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Institut de minéralogie, de physique des matériaux et de cosmochimie
UMR 7590 - Sorbonne Université/CNRS/IRD/MNHN

Soutennace de thèse de Julie Aufort

Julie Aufort, doctorante dans l'équipe Minéralogie environnementale, soutient sa thèse le lundi 9 juillet 2018 à 14 h.

IMPMC - Sorbonne Université - 4 place Jussieu, 75005 Paris, tour 23, 4e étage, couloir 22-23, salle 401

Fossilisation des apatites biologiques : approche cristallochimique et applications géochimiques

Fossilisation of biological apatites: crystal-chemical approach and geochemical applications

 

Résumé

Les fragments de squelettes de vertébrés préservés sous forme de fossiles fournissent des informations  paléo-environnementales  uniques  via  leur  composition isotopique  et  leur  teneur  en éléments traces. Toutefois la validité de ces informations dépend crucialement de la préservation de l’enregistrement géochimique biogénique au cours de la fossilisation. Ce travail a pour objectif de comprendre comment s’effectue l’acquisition de l’information géochimique puis sa préservation en étudiant les propriétés de fractionnement isotopique de l’apatite, constituant inorganique majeur des os et dents de vertébrés, et les mécanismes de transformations cristallochimiques impliqués par la fossilisation. Celles-ci sont sondées à l’échelle atomique à l’aide des spectroscopies ATR-FTIR et RMN du solide, leur interprétation s’appuyant sur la modélisation des spectres ATR-FTIR et le calcul ab initio (DFT) des propriétés de fractionnement isotopique à l’équilibre de l’apatite.

Les transformations à l’échelle atomique observées suite à l’altération d’os actuel en solution aqueuse attestent d’un processus de dissolution partielle de l’apatite biogénique et de formation de fluoro- ou hydroxy- apatite carbonatée secondaire à la surface des cristallites, selon la présence ou non de fluor en solution. Ces résultats ont ensuite été appliqués à l’étude de la transformation d’os fossiles issus des environnements karstiques de Bolt’s Farm dans le Berceau de l’humanité (Afrique du Sud) et des environnements fluvio-lacustres volcano-sédimentaires des collines Tugen dans la vallée du Rift Grégory (Kenya). La formation de fluorapatite carbonatée est systématiquement observée, de l’hydroxyapatite carbonatée est également formée dans les fossiles de Bolt’s Farm moins fluorés, soulignant ainsi le potentiel des ossements fossiles à révéler les conditions précoces de fossilisation. Un degré maximal de transformation, aussi bien des os fossiles que des os actuels altérés, est observé à environ 60 % d’apatite secondaire, suggérant l’idée d’un rôle protecteur de cette phase contre la dissolution totale de l’apatite primaire.

 

Abstract

Chemical and stable isotope compositions of fossil remains of vertebrates provide unique palaeo-environmental information. However, its reliability depends on the preservation of the biogenic geochemical record during the fossilisation process. This work aims to understand how the geochemical record is acquired and preserved by studying the isotopic fractionation properties of apatite, the main inorganic constituent of vertebrates’ bones and teeth, and the crystal-chemical transformations occurring during fossilisation. These transformations are probed at the atomic scale using ATR-FTIR and solid- state NMR spectroscopies and their interpretation is supported by the modelling of ATR-FTIR spectra and DFT calculations of theoretical equilibrium isotopic fractionation properties.

Atomic scale transformations of modern bones altered in aqueous solutions consist of partial dissolution of the biogenic apatite and formation of secondary carbonated fluoro- or hydroxy- apatite, depending on the presence or absence of fluoride in the solution. These results were then applied to the study of the transformation of fossil bones from the karstic environments of Bolt’s Farm cave system (Cradle of Humankind, South Africa) and from the fluvio-lacustrine environments of the Tugen Hills (Gregory Rift, Kenya). Systematic formation of secondary carbonated fluorapatite is observed, as well as formation of secondary carbonated hydroxyapatite in the less fluorinated Bolt’s Farm fossils, highlighting the potentiality of fossil bones to record local physical-chemical conditions prevailing in fossilisation environments. The ~ 60 % maximum fraction of secondary apatite observed in fossils and modern bones altered under controlled conditions suggests it has a protective role against further dissolution of the primary bioapatite.

 

Jury

  • Pascale Roy, DR (Synchrotron SOLEIL) - Rapporteure
  • Christophe Drouet, DR (CIRIMAT, Université de Toulouse) - Rapporteur
  • Maguy Jaber, Professeure (LAMS, Sorbonne Université) - Examinatrice
  • Antoine Zazzo, DR (MNHN) - Examinateur
  • Etienne Balan, Professeur (IMPMC, Sorbonne Université) - Directeur de thèse
  • Christel Gervais, Professeure (LCMCP, Sorbonne Université) - Invitée
  • Loïc Ségalen, Professeur (ISTEP, Sorbonne Université) - Invité

 

Cécile Duflot - 15/06/18

Traductions :

    Plongée glacée dans les entrailles d’une cyanobactérie biominéralisante

    L’existence de bactéries formant des phases amorphes de carbonate de calcium intracellulaires semble paradoxale. En effet, la concentration en ions calcium nécessaire pour permettre la précipitation de ces phases minérales est bien supérieure au seuil de toxicité admis pour les intérieurs cellulaires...

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    Sorbonne Université - 4, place Jussieu - BC 115 - 75252 Paris Cedex 5

     

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